طبق ماده ۳۲ قانون ثبت اسناد و املاک و همچنین مقررات قانون تشکیلات و اختیارات سازمان اوقاف و امور خیریه تقاضای ثبت املاک موقوفه به این شرح میباشد:
در موقوفات عام تقاضای ثبت ملک بر عهده متولی موقوفه است. در صورتی که موقوفه متولی نداشته باشد یا متولی مجهول باشد این وظیفه مستقیما بر عهده اداره اوقاف و امور خیریه میباشد.
در موقوفات خاص درخواست ثبت بر عهده متولی و همچنین موقوف علیهم (اشخاصی که وقف به نفع آن ها شده است) میباشد و هر کدام حق تقاضای ثبت ملک را دارند.
لازم به ذکر است طبق آیین نامه اجرایی قانون ثبت اگر متولی در موقوفات عام از درخواست ثبت امتناع کند یا کوتاهی نماید اداره اوقاف راسا برای حفظ حقوق موقوفه جهت ثبت ملک اقدام خواهد کرد.