مدیر تصفیه در اجرای وظایف خود به عنوان امین و وکیل شرکت شناخته می شود و در صورت کوتاهی یا تخلف، دارای مسئولیت های مدنی، کیفری و انتظامی است. بر اساس ماده ۲۲۵ لایحه اصلاحی قانون تجارت، اگر مدیر تصفیه در اثر تقصیر یا تخلف از قوانین و اساسنامه، باعث ورود خسارت به شرکت، سهامداران یا طلبکاران شود، ملزم به جبران خسارات وارده است. این مسئولیت شامل مواردی همچون تاخیر غیرموجه در تصفیه، عدم رعایت اولویت پرداخت طلبکاران و یا تقسیم دارایی قبل از تصفیه کامل دیون می باشد.
از نظر کیفری، طبق مواد ۲۵۸ و ۲۵۹ لایحه قانونی مذکور، چنانچه مدیر تصفیه اموال یا اعتبارات شرکت را برخلاف منافع شرکت و برای اهداف شخصی یا به نفع شرکت دیگر استفاده کند، به مجازات حبس و جریمه نقدی محکوم خواهد شد. همچنین بر اساس ماده ۲۳۰، در صورت عدم انجام وظایف قانونی، مجمع عمومی یا دادگاه صادرکننده حکم تصفیه، صلاحیت عزل مدیر تصفیه و جایگزینی فرد جدید را دارند. در نهایت، مدیر تصفیه موظف است تمامی اقدامات خود را در چارچوب قانون تجارت انجام دهد و هرگونه خروج از این چارچوب، وی را در برابر اشخاص ثالث و شرکا به صورت انفرادی یا تضامنی مسئول قرار می دهد.