خیر، قوانین انصراف از حوزه علمیه با دانشگاه متفاوت است. از نظر ضوابط آموزشی، دانشگاه ها تابع آیین نامه های وزارت علوم، تحقیقات و فناوری یا وزارت بهداشت هستند، در حالی که حوزه علمیه تابع آیین نامه های داخلی مصوب شورای عالی حوزه های علمیه میباشد.
از لحاظ نظام وظیفه، طبق ماده ۳۳ قانون خدمت وظیفه عمومی، برای طلاب و دانشجویان معافیت تحصیلی صادر میشود. همچنین طبق ماده ۳۴ قانون خدمت وظیفه عمومی، مشمولانی که از حوزه علمیه یا دانشگاه انصراف می دهند، موظفند حداکثر ظرف مدت ۱ سال از تاریخ انصراف، خود را به سازمان خدمت وظیفه عمومی معرفی نمایند.
با این وجود، تعهدات خدمت، جریمه مالی احتمالی، شرایط بازگشت به تحصیل و نحوه معادل سازی دروس انصرافی در حوزه علمیه کاملا تابع آیین نامه اختصاصی مرکز مدیریت حوزه های علمیه است و قوانین آن با دانشگاه یکسان نیست.